La Procuraduría General de la Nación formuló pliego de cargos al exministro de Agricultura Juan Camilo Restrepo Salazar por una aparente extralimitación en sus funciones cuando se desempeñaba al frente de esa cartera. 

Según el Ministerio Público, Restrepo habría asumido competencias que eran propias del comité interventor para solicitar a Fedegán que modificara sus estatutos en un término no mayor a 6 meses para hacer su funcionamiento más transparente, so pena de iniciar un proceso de incumplimiento contractual para declarar la caducidad del contrato celebrado entre el Ministerio y esa federación para la administración del Fondo del Ganado y de la Leche, desconociendo presuntamente el debido proceso del contratista al no dársele la oportunidad de pronunciarse previamente.

"El doctor Restrepo Salazar habría asumido competencias que eran propias del comité interventor, ya que la función de verificar el cumplimiento de las obligaciones así como adelantar las actuaciones derivadas del posible incumplimiento estaban asignadas a este comité y no al ministro de la cartera, de acuerdo con la cláusula novena del Contrato de Administración número 026 de 2004, en consonancia con el manual de interventoría y supervisión vigente para la época de los hechos", dice la Procuraduría.

El Ministerio Público sostiene que el ex alto funcionario pudo haber quebrantado el principio de legalidad, lo que se considera una falta grave.